Akcja Filozofa w kamieniołomach toczy się w IV wieku p.n.e. w Tarencie i Syrakuzach. Czytelnik wkracza w świat reguł rządzących bractwem pitagorejczyków. To z tej italskiej wspólnoty wywodzi się główny bohater Myllias. Matematyczna mądrość i żelazna logika pozwalają mu przetrwać i pokonać przeciwności losu, na które narazili go zaciekli przeciwnicy pitagorejczyków. Głównemu bohaterowi towarzyszą nienawiść, miłość i wieczna ucieczka. Czy wychodzi zwycięsko z opresji?